MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA01

Total Repeats: 21852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009429	GGC	2	6	19	24	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009429	CGC	2	6	171	176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009429	C	6	6	243	248	0 %	0 %	0 %	100 %	146279171
4	NC_009429	CCT	2	6	283	288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279171
5	NC_009429	GCCG	2	8	382	389	0 %	0 %	50 %	50 %	146279171
6	NC_009429	GGC	2	6	436	441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279171
7	NC_009429	GAG	2	6	452	457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279171
8	NC_009429	CGC	2	6	464	469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
9	NC_009429	GCCC	2	8	499	506	0 %	0 %	25 %	75 %	146279171
10	NC_009429	TCGGG	2	10	537	546	0 %	20 %	60 %	20 %	146279171
11	NC_009429	CAA	2	6	580	585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146279171
12	NC_009429	TGG	2	6	654	659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279171
13	NC_009429	TCG	2	6	720	725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279171
14	NC_009429	GAC	2	6	857	862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279171
15	NC_009429	CGC	2	6	877	882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
16	NC_009429	GGT	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279171
17	NC_009429	TCT	2	6	954	959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279171
18	NC_009429	CG	3	6	1053	1058	0 %	0 %	50 %	50 %	146279171
19	NC_009429	G	6	6	1128	1133	0 %	0 %	100 %	0 %	146279171
20	NC_009429	GCG	2	6	1188	1193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279171
21	NC_009429	TCA	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279171
22	NC_009429	CCG	2	6	1203	1208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
23	NC_009429	GAG	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279171
24	NC_009429	CGC	2	6	1363	1368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
25	NC_009429	GCC	2	6	1370	1375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
26	NC_009429	GC	3	6	1392	1397	0 %	0 %	50 %	50 %	146279171
27	NC_009429	GTG	3	9	1472	1480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279171
28	NC_009429	CGG	2	6	1482	1487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279171
29	NC_009429	GAG	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279171
30	NC_009429	CGC	2	6	1566	1571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
31	NC_009429	GC	3	6	1598	1603	0 %	0 %	50 %	50 %	146279171
32	NC_009429	TGC	2	6	1629	1634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279171
33	NC_009429	CGC	2	6	1669	1674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
34	NC_009429	CGCC	2	8	1706	1713	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_009429	GCC	2	6	1718	1723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009429	CTT	2	6	1748	1753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009429	GCCC	2	8	1778	1785	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_009429	CGGCG	2	10	1788	1797	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009429	GAG	3	9	1849	1857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009429	GC	3	6	1887	1892	0 %	0 %	50 %	50 %	146279172
41	NC_009429	CGG	2	6	1911	1916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
42	NC_009429	CGG	2	6	1954	1959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
43	NC_009429	GCG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
44	NC_009429	GCG	2	6	1983	1988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
45	NC_009429	ACG	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
46	NC_009429	TCGG	2	8	2141	2148	0 %	25 %	50 %	25 %	146279172
47	NC_009429	CGA	2	6	2163	2168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
48	NC_009429	CAGC	2	8	2184	2191	25 %	0 %	25 %	50 %	146279172
49	NC_009429	CAC	2	6	2194	2199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279172
50	NC_009429	GAC	2	6	2203	2208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
51	NC_009429	ACG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
52	NC_009429	CGG	2	6	2229	2234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
53	NC_009429	GGC	2	6	2269	2274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
54	NC_009429	ACG	2	6	2285	2290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
55	NC_009429	CGG	2	6	2301	2306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
56	NC_009429	CGGC	2	8	2331	2338	0 %	0 %	50 %	50 %	146279172
57	NC_009429	CAC	2	6	2341	2346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279172
58	NC_009429	CCGGG	2	10	2361	2370	0 %	0 %	60 %	40 %	146279172
59	NC_009429	CGG	2	6	2373	2378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
60	NC_009429	GGC	2	6	2401	2406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
61	NC_009429	CGG	2	6	2407	2412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
62	NC_009429	CGG	2	6	2421	2426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
63	NC_009429	AGC	2	6	2481	2486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
64	NC_009429	GCG	3	9	2490	2498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
65	NC_009429	CGG	2	6	2538	2543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
66	NC_009429	CAG	2	6	2546	2551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
67	NC_009429	GCG	2	6	2553	2558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
68	NC_009429	GCC	2	6	2567	2572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279172
69	NC_009429	CCA	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279172
70	NC_009429	GAA	2	6	2618	2623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279172
71	NC_009429	GC	3	6	2624	2629	0 %	0 %	50 %	50 %	146279172
72	NC_009429	CGA	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
73	NC_009429	GCC	2	6	2654	2659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279172
74	NC_009429	GC	4	8	2677	2684	0 %	0 %	50 %	50 %	146279172
75	NC_009429	CCGG	2	8	2709	2716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009429	GCG	2	6	2717	2722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009429	GCC	3	9	2726	2734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009429	GA	3	6	2778	2783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009429	TCCG	2	8	2823	2830	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009429	GTG	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009429	GAT	2	6	2873	2878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009429	CCG	2	6	3007	3012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279173
83	NC_009429	GGC	2	6	3056	3061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
84	NC_009429	GCC	2	6	3165	3170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279173
85	NC_009429	TCC	2	6	3196	3201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279173
86	NC_009429	GCCCG	2	10	3209	3218	0 %	0 %	40 %	60 %	146279173
87	NC_009429	GCG	2	6	3219	3224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
88	NC_009429	CGC	2	6	3230	3235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279173
89	NC_009429	TCC	2	6	3272	3277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279173
90	NC_009429	GGC	2	6	3406	3411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
91	NC_009429	CGG	2	6	3445	3450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
92	NC_009429	GGC	2	6	3557	3562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
93	NC_009429	CCTGG	2	10	3617	3626	0 %	20 %	40 %	40 %	146279173
94	NC_009429	GGC	2	6	3692	3697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
95	NC_009429	GGGC	2	8	3719	3726	0 %	0 %	75 %	25 %	146279173
96	NC_009429	GAC	2	6	3755	3760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279173
97	NC_009429	CGCCCT	2	12	3761	3772	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	146279173
98	NC_009429	GCT	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279173
99	NC_009429	GC	3	6	3790	3795	0 %	0 %	50 %	50 %	146279173
100	NC_009429	CGGCC	2	10	3818	3827	0 %	0 %	40 %	60 %	146279173
101	NC_009429	GCT	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279173
102	NC_009429	GC	3	6	3880	3885	0 %	0 %	50 %	50 %	146279173
103	NC_009429	CGC	3	9	3913	3921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279173
104	NC_009429	TGG	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279173
105	NC_009429	GCT	2	6	3998	4003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279173
106	NC_009429	CAT	2	6	4010	4015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279173
107	NC_009429	GGC	2	6	4100	4105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
108	NC_009429	GGCG	2	8	4131	4138	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009429	ATC	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279174
110	NC_009429	CGA	2	6	4267	4272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279174
111	NC_009429	GAT	3	9	4370	4378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279174
112	NC_009429	CGG	2	6	4443	4448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009429	CGGC	2	8	4459	4466	0 %	0 %	50 %	50 %	146279175
114	NC_009429	GAC	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
115	NC_009429	AGCC	2	8	4602	4609	25 %	0 %	25 %	50 %	146279175
116	NC_009429	AGA	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279175
117	NC_009429	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279175
118	NC_009429	GAC	2	6	4889	4894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
119	NC_009429	TGA	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279175
120	NC_009429	CAG	2	6	4925	4930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
121	NC_009429	CCG	2	6	4943	4948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279175
122	NC_009429	CTT	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279175
123	NC_009429	AGA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279175
124	NC_009429	AGG	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279175
125	NC_009429	GTG	3	9	5076	5084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279175
126	NC_009429	CCG	2	6	5107	5112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279175
127	NC_009429	CAT	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279175
128	NC_009429	CCGATC	2	12	5316	5327	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146279175
129	NC_009429	CAG	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
130	NC_009429	ATC	2	6	5436	5441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279175
131	NC_009429	ATG	2	6	5478	5483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279175
132	NC_009429	CGA	2	6	5524	5529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
133	NC_009429	GGGC	2	8	5563	5570	0 %	0 %	75 %	25 %	146279175
134	NC_009429	C	6	6	5640	5645	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_009429	CCGG	2	8	5655	5662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009429	CGC	2	6	5665	5670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009429	GGC	2	6	5676	5681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009429	CGG	2	6	5702	5707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009429	CTG	2	6	5710	5715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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269	NC_009429	GCG	2	6	11539	11544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279182
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273	NC_009429	CGCC	2	8	11686	11693	0 %	0 %	25 %	75 %	146279182
274	NC_009429	TGC	2	6	11698	11703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279182
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395	NC_009429	GCC	2	6	17293	17298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
396	NC_009429	C	6	6	17317	17322	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
397	NC_009429	GGC	2	6	17374	17379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279187
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399	NC_009429	GCG	2	6	17504	17509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279187
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